Мониторинг необходим для своевременного выявления и прогнозирования появления отрицательных процессов, которые влияют на качество воды в объектах и их состояние. Включает в себя разработку и выполнение мер по недопущению отрицательных последствий из-за низкого качества воды.

Оценка качества воды по наличию водных организмов, являющихся индикаторами ее загрязненности. Позволяет диагностировать ранние нарушения в наиболее чувствительных компонентах биотических сообществ и оценивать их значимость для всей экосистемы в ближайшем и отдаленном будущем.

Проект расчета ущерба водным биологическим ресурсам включает:

• рыбохозяйственную характеристику водоема;
• определение видов воздействия конкретных работ на водные биологические ресурсы и среду их обитания;
• расчет ущерба и определение вариантов восстановительных и компенсационных мероприятий.

С помощью сапробиологического анализа возможно оценить качество воды, путем выявления загрязнения окружающей среды (уже состоявшееся или происходящее) по функциональным характеристикам видов и экологическим характеристикам сообществ организмов.

Оценка влияния добычи природных ресурсов (в том числе нефти), а также сопутствующих видов работ, на экосистемы прилегающих и близлежащих акваторий.

Эвтрофикация создает острые экологические проблемы. Чистая вода необходима для многих промышленных процессов, людей и домашнего скота, коммерческого и спортивного рыболовства, функционирования курортных зон и навигации.